Gydyti ligų ir kenkėjų pažeistus augalus sunku ir ne visada pasiseka. Neteisūs tie, kurie galvoja, kad netinkamą agrotechniką galima kompensuoti cheminėmis augalų apsaugos priemonėmis. Specialistai neturi pamiršti, kad kiekvienos augalų rūšies, o kartais, net ir veislių poreikis šviesai, šilumai, drėgmei yra skirtingi. Į tai reikia atsižvelgti grupuojant augalus šiltnamiuose. Juose turi būti įrengti ventiliatoriai, maišantys orą, kad vanduo nesikondensuotų ant lubų ir sienų.
Labai svarbu augalams parinkti tinkamą substratą. Per sunki, drėgna žemė, kaip ir labai lengva, nederlinga, greit perdžiūstanti, nepageidautina. Periodiškai purenamoje dirvoje augalai geriau auga, būna atsparesni ligoms. Dirva turi būti atitinkamos reakcijos, Tręšti reikia visapusiškai ir saikingai. Auginti ligoms atsparias veisles. Augalus dauginti ir persodinti tinkamiausiu laiku. Kuo greičiau šalinti ligotų augalų liekanas ir atskiras dalis.
Grybinėmis ligomis apkrėstas augalų dalis reikia šalinti labai atsargiai, kad neišplistų sporos.